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Os arquivos de imagem do módulo de certificados do moodle ficam na seguinte pasta “mod -> certificate -> pix”
Que possui as seguintes subpastas:
border: Que é onde ficará as imagens que você deseja colocar como borda do certificado. É aconselhável que sejam imagens no formato png. As bordas são opcionais, pois o módulo também pode criá-las.
seals: Aqui fica os selos que você pode colocar no certificado. Também é aconselhável que sejam imagens no formato png.
signatures: Nesta pasta fica as assinaturas do certificado, ou as imagens que vão no rodapé.
watermarks: E por útilmo a pasta watermarks, que seria as marcas d’água do certificado, de preferência usar imagens no formato png.

É aconselhável que as imagens sejam criadas no formato png, com o fundo transparente, para que uma não sobreponha a outra.

E para criar os certificados via moodle você deve estar logado como administrador e ativar o moodle para edição.
Feito isso, acesso o curso que você deseja criar o certificado, clique sobre “Acrescentar atividade…” e escolha a opção “Certificado”.
Na próxima página preencha os campos obrigatórios e escolha as opções que vão aparecer no certificado.
E no final da página, no conteúdo “Design Options” escolha as imagens do certificado:

Border Image: Aqui você escolhe a imagem da borde que irá aparecer no certificado.
Border Linhas: Se você preferir não colocar nenhuma imagem como borda você pode escolher nessa opção uma borda automática gerada pelo moodle.
Imprimir marca d água: Nesta opção você escolhe a imagem que ficará como marca d’água do certificado. Ou podendo deixar sem nenhuma também.
Imprimir Assinatura: A parte de assinaturas é onde você escolhe as imagens que irão aparecer no rodapé do certificado, mas essas imagens também são opcionais.
Imprimir Selo: E por último você escolhe os selos que ficarão no certificado, isso também é opcional.

Só lembrando que para que as imagens apareçam para escolha elas devem estar nas suas respectivas pastas.

Seguindo esses passos os certificados já estarão disponíveis no moodle.